MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 101179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017267	GATG	2	8	42	49	25 %	25 %	50 %	0 %	384417080
2	NC_017267	CCCG	2	8	87	94	0 %	0 %	25 %	75 %	384417080
3	NC_017267	TCG	2	6	176	181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417080
4	NC_017267	GCA	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
5	NC_017267	GCC	2	6	418	423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
6	NC_017267	TGT	2	6	473	478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417080
7	NC_017267	GCA	2	6	482	487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
8	NC_017267	CGG	2	6	518	523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417080
9	NC_017267	TTC	2	6	583	588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
10	NC_017267	GAT	2	6	594	599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417080
11	NC_017267	CAG	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
12	NC_017267	TTC	2	6	682	687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
13	NC_017267	TTC	2	6	715	720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
14	NC_017267	GCC	2	6	746	751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
15	NC_017267	ATC	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417080
16	NC_017267	CG	3	6	782	787	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
17	NC_017267	GCCTG	2	10	821	830	0 %	20 %	40 %	40 %	384417080
18	NC_017267	GTCG	2	8	837	844	0 %	25 %	50 %	25 %	384417080
19	NC_017267	CGAT	2	8	845	852	25 %	25 %	25 %	25 %	384417080
20	NC_017267	CCG	2	6	853	858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
21	NC_017267	CGA	2	6	921	926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
22	NC_017267	AAG	2	6	946	951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417080
23	NC_017267	GC	3	6	980	985	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
24	NC_017267	TGG	2	6	995	1000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417080
25	NC_017267	CG	3	6	1001	1006	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
26	NC_017267	GC	4	8	1068	1075	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
27	NC_017267	ACT	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417080
28	NC_017267	GCCG	2	8	1255	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
29	NC_017267	ACCAC	2	10	1265	1274	40 %	0 %	0 %	60 %	384417080
30	NC_017267	TGC	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417080
31	NC_017267	TGCC	2	8	1284	1291	0 %	25 %	25 %	50 %	384417080
32	NC_017267	CCTG	2	8	1726	1733	0 %	25 %	25 %	50 %	384417081
33	NC_017267	GGAC	2	8	1762	1769	25 %	0 %	50 %	25 %	384417081
34	NC_017267	TGG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417081
35	NC_017267	ACC	2	6	1847	1852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417081
36	NC_017267	GC	3	6	1882	1887	0 %	0 %	50 %	50 %	384417081
37	NC_017267	CCGT	2	8	1994	2001	0 %	25 %	25 %	50 %	384417081
38	NC_017267	GTG	3	9	2027	2035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417081
39	NC_017267	GCA	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417081
40	NC_017267	CTA	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417081
41	NC_017267	CTG	2	6	2117	2122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417081
42	NC_017267	TTG	2	6	2141	2146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417081
43	NC_017267	GGC	2	6	2207	2212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417081
44	NC_017267	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417081
45	NC_017267	TGCG	2	8	2436	2443	0 %	25 %	50 %	25 %	384417081
46	NC_017267	CGAA	2	8	2469	2476	50 %	0 %	25 %	25 %	384417081
47	NC_017267	AAG	3	9	2544	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417081
48	NC_017267	CGA	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417081
49	NC_017267	AGT	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417081
50	NC_017267	CCTG	2	8	3719	3726	0 %	25 %	25 %	50 %	384417082
51	NC_017267	TCG	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
52	NC_017267	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417083
53	NC_017267	AAC	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417083
54	NC_017267	TGGAA	2	10	4041	4050	40 %	20 %	40 %	0 %	384417083
55	NC_017267	GGC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417083
56	NC_017267	TGC	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
57	NC_017267	CGT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
58	NC_017267	GCG	2	6	4215	4220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417083
59	NC_017267	GTG	2	6	4221	4226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417083
60	NC_017267	CCG	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417083
61	NC_017267	CGT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
62	NC_017267	GC	4	8	4303	4310	0 %	0 %	50 %	50 %	384417083
63	NC_017267	GCT	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
64	NC_017267	GC	3	6	4341	4346	0 %	0 %	50 %	50 %	384417083
65	NC_017267	CG	3	6	4601	4606	0 %	0 %	50 %	50 %	384417083
66	NC_017267	CAAGC	2	10	4661	4670	40 %	0 %	20 %	40 %	384417083
67	NC_017267	GCCT	2	8	4682	4689	0 %	25 %	25 %	50 %	384417083
68	NC_017267	GAC	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417083
69	NC_017267	CAC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417083
70	NC_017267	GC	3	6	4784	4789	0 %	0 %	50 %	50 %	384417083
71	NC_017267	CCCG	2	8	4846	4853	0 %	0 %	25 %	75 %	384417083
72	NC_017267	CGA	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
73	NC_017267	TGC	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
74	NC_017267	GGT	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
75	NC_017267	CGA	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
76	NC_017267	CGA	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
77	NC_017267	GTG	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
78	NC_017267	GAA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417084
79	NC_017267	TGC	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
80	NC_017267	CGG	2	6	5377	5382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
81	NC_017267	CGA	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
82	NC_017267	CGG	2	6	5413	5418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
83	NC_017267	GGCGTG	2	12	5426	5437	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384417084
84	NC_017267	GGT	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
85	NC_017267	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
86	NC_017267	AGC	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
87	NC_017267	CAC	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417084
88	NC_017267	CCGT	2	8	5588	5595	0 %	25 %	25 %	50 %	384417084
89	NC_017267	GGCGC	2	10	5635	5644	0 %	0 %	60 %	40 %	384417084
90	NC_017267	CGA	2	6	5692	5697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
91	NC_017267	CGA	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
92	NC_017267	GGC	2	6	5735	5740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
93	NC_017267	CGC	2	6	5778	5783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
94	NC_017267	TGG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
95	NC_017267	CAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417084
96	NC_017267	GGC	2	6	5909	5914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
97	NC_017267	CCGCG	2	10	5932	5941	0 %	0 %	40 %	60 %	384417084
98	NC_017267	CGA	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
99	NC_017267	CGG	2	6	6117	6122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
100	NC_017267	GC	3	6	6140	6145	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
101	NC_017267	CGAA	2	8	6171	6178	50 %	0 %	25 %	25 %	384417084
102	NC_017267	TCG	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
103	NC_017267	CG	3	6	6211	6216	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
104	NC_017267	GC	3	6	6218	6223	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
105	NC_017267	CG	3	6	6229	6234	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
106	NC_017267	GC	3	6	6239	6244	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
107	NC_017267	CGC	2	6	6254	6259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
108	NC_017267	GC	3	6	6264	6269	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
109	NC_017267	TGC	2	6	6405	6410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
110	NC_017267	GC	3	6	6443	6448	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
111	NC_017267	CGA	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
112	NC_017267	ACC	2	6	6546	6551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417084
113	NC_017267	CAT	2	6	6553	6558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417084
114	NC_017267	TGA	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417084
115	NC_017267	CCGACG	2	12	6567	6578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384417084
116	NC_017267	CTT	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417084
117	NC_017267	GCC	2	6	6670	6675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
118	NC_017267	GCG	2	6	6767	6772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
119	NC_017267	CGA	2	6	6787	6792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
120	NC_017267	GCC	2	6	6793	6798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
121	NC_017267	CTG	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
122	NC_017267	GC	3	6	6860	6865	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
123	NC_017267	GCC	2	6	6913	6918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
124	NC_017267	GCAG	2	8	6976	6983	25 %	0 %	50 %	25 %	384417084
125	NC_017267	CG	3	6	7009	7014	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
126	NC_017267	TGG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
127	NC_017267	CCG	2	6	7072	7077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
128	NC_017267	GAA	2	6	7088	7093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417084
129	NC_017267	TGC	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
130	NC_017267	GCG	2	6	7128	7133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
131	NC_017267	GC	3	6	7188	7193	0 %	0 %	50 %	50 %	384417084
132	NC_017267	CAA	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417084
133	NC_017267	GCT	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
134	NC_017267	GCC	2	6	7275	7280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
135	NC_017267	AGC	2	6	7320	7325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
136	NC_017267	CGT	2	6	7355	7360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
137	NC_017267	GCC	2	6	7391	7396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
138	NC_017267	CGC	2	6	7439	7444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
139	NC_017267	GCC	2	6	7610	7615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
140	NC_017267	GCT	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417085
141	NC_017267	CGC	2	6	7658	7663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
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143	NC_017267	GCC	2	6	7782	7787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
144	NC_017267	TGT	2	6	7855	7860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417085
145	NC_017267	ACT	2	6	7861	7866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417085
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148	NC_017267	CG	3	6	7913	7918	0 %	0 %	50 %	50 %	384417085
149	NC_017267	CGC	2	6	7952	7957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
150	NC_017267	GAA	2	6	8043	8048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417085
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156	NC_017267	GCC	2	6	8241	8246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
157	NC_017267	GCA	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417085
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164	NC_017267	GC	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	384417086
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168	NC_017267	GCC	2	6	8810	8815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417086
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247	NC_017267	CG	3	6	12517	12522	0 %	0 %	50 %	50 %	384417089
248	NC_017267	AGT	2	6	12586	12591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417090
249	NC_017267	TGC	2	6	12653	12658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417090
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252	NC_017267	GAAG	2	8	12735	12742	50 %	0 %	50 %	0 %	384417090
253	NC_017267	CGCGC	2	10	12754	12763	0 %	0 %	40 %	60 %	384417090
254	NC_017267	ACG	2	6	12806	12811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417090
255	NC_017267	CGCAG	2	10	12852	12861	20 %	0 %	40 %	40 %	384417090
256	NC_017267	GCC	2	6	12873	12878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417090
257	NC_017267	TGG	2	6	13017	13022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417091
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259	NC_017267	ATC	2	6	13087	13092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417091
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261	NC_017267	CCG	4	12	13180	13191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417091
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265	NC_017267	GAA	2	6	13374	13379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417091
266	NC_017267	GAA	2	6	13389	13394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417091
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499	NC_017267	TGCGA	2	10	24940	24949	20 %	20 %	40 %	20 %	384417100
500	NC_017267	GC	3	6	25009	25014	0 %	0 %	50 %	50 %	384417101

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